要将低温蒸汽甲醛灭菌器出口到菲律宾，您可能需要办理以下资质认证：

1.      FDA（菲律宾食品和药品监管局）注册：申请FDA注册是在菲律宾市场销售医疗器械的基本要求。您需要提交产品注册申请，包括产品的技术规格、测试报告、质量管理体系证明等文件。

2.      Product Notification Certificate（产品通知证书）：根据菲律宾FDA的要求，部分医疗器械需要获得产品通知证书。具体要求可能因产品的分类和特性而异。

3.      GMP（良好生产规范）认证：根据菲律宾FDA的规定，某些医疗器械可能需要获得GMP认证，以证明其生产过程符合良好生产规范。

4.      ISO认证：持有ISO认证（如ISO 13485）也有助于增加产品在菲律宾市场的信任度，尽管它可能不是强制要求。